Диаграмма в UFO-toolkit – это способ представления взаимосвязей между UFO-элементами. Диаграмма – это основная часть модели системы, на диаграмме представляются узлы моделируемой системы и связи, потоки информации и данных между ними.

Диаграмма содержит множество UFO-элементов и представляет собой иерархию. Верхняя, контекстная диаграмма обычно содержит узел, являющийся моделируемой системой и демонстрирует связь моделируемой системы с внешним миром, другими системами. При необходимости контекстную диаграмму декомпозируют, для одного или нескольких UFO-элементов создают функции, и эти функции представляют также в виде диаграмм. Количество уровней вложенности не ограничено.

Диаграммы организованы в виде графо-аналитических моделей. Диаграммы представляют собой множество квадратиков – UFO-элементов, соединённых стрелочками – связями.