В основе инструментария UFO-toolkit лежит метод системного анализа Узел – Функция – Объект (Unit – Function – Object) UFO-подход. Метод UFO-анализа – это оригинальный, новый подход к системе как функциональному объекту, состоящий в представлении ее в виде трехэлементной конструкции: «Узел–Функция–Объект» (UFO-подход). На основе данного подхода разработан формально-семантический метод UFO-анализа, позволяющий конструировать системно-объектные модели как комбинации UFO-элементов.